Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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