Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPM6BQ13491 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms