Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC4Q13426 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC4Q13426 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms