Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RESTQ13127 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RESTQ13127 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RESTQ13127 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RESTQ13127 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RESTQ13127 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RESTQ13127 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RESTQ13127 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RESTQ13127 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RESTQ13127 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RESTQ13127 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RESTQ13127 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RESTQ13127 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RESTQ13127 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RESTQ13127 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RESTQ13127 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RESTQ13127 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RESTQ13127 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RESTQ13127 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RESTQ13127 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RESTQ13127 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RESTQ13127 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RESTQ13127 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RESTQ13127 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RESTQ13127 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RESTQ13127 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RESTQ13127 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RESTQ13127 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RESTQ13127 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RESTQ13127 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RESTQ13127 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RESTQ13127 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RESTQ13127 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RESTQ13127 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RESTQ13127 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RESTQ13127 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RESTQ13127 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RESTQ13127 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RESTQ13127 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RESTQ13127 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RESTQ13127 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RESTQ13127 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RESTQ13127 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RESTQ13127 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RESTQ13127 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RESTQ13127 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RESTQ13127 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RESTQ13127 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RESTQ13127 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RESTQ13127 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RESTQ13127 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RESTQ13127 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RESTQ13127 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RESTQ13127 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RESTQ13127 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RESTQ13127 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RESTQ13127 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RESTQ13127 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RESTQ13127 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RESTQ13127 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RESTQ13127 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RESTQ13127 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RESTQ13127 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RESTQ13127 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RESTQ13127 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RESTQ13127 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RESTQ13127 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RESTQ13127 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RESTQ13127 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RESTQ13127 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
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