Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWF1Q12792 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TWF1Q12792 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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