Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAGPQ0VAQ4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms