Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4F3Q08477 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms