Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 TIF4632YGL049C 2745 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 IRC22YEL001C 678 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 LSM4YER112W 564 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 YFR045WYFR045W 930 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 YGL138CYGL138C 1038 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 AIM19YIL087C 474 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 BAT2YJR148W 1131 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 MET14YKL001C 609 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 FBP1YLR377C 1047 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 PNG1YPL096W 1092 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 VPS69YPR087W 321 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 OPY1YBR129C 987 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 ERV15YBR210W 429 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 ADP1YCR011C 3150 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 SPB4YFL002C 1821 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 UBP8YMR223W 1416 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 GRX3YDR098C 858 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 CAP2YIL034C 864 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 GCD14YJL125C 1152 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 MMM1YLL006W 1281 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 YAR023CYAR023C 540 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 MCM1YMR043W 861 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 COS1YNL336W 1146 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 YOR238WYOR238W 912 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 ALG6YOR002W 1635 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 IMD2YHR216W 1572 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 NOP8YOL144W 1455 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 IDS2YJL146W 1410 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 YDR220CYDR220C 294 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 TOS8YGL096W 831 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 YIP5YGL161C 933 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 CDC42YLR229C 576 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 TOM7YNL070W 183 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 YDR131CYDR131C 1671 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 UGA3YDL170W 1587 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 EGT2YNL327W 3126 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 URC2YDR520C 2319 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 GRC3YLL035W 1899 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 FAR10YLR238W 1437 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 THI7YLR237W 1797 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 APP1YNL094W 1764 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 YDL027CYDL027C 1263 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 RPL13AYDL082W 600 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 ARF2YDL137W 546 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 PDS1YDR113C 1122 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 UBC8YEL012W 657 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 NDL1YLR254C 570 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 SME1YOR159C 285 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 CIN2YPL241C 807 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 MUD1YBR119W 897 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 PLM2YDR501W 1566 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 XKS1YGR194C 1803 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 MET17YLR303W 1335 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 NMD3YHR170W 1557 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 ALR2YFL050C 2577 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 COS12YGL263W 1143 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 PRP38YGR075C 729 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 EOS1YNL080C 1101 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 YOR366WYOR366W 354 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 CBP3YPL215W 1008 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 REI1YBR267W 1182 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 MRPL27YBR282W 441 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 ACA1YER045C 1470 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 YGL176CYGL176C 1665 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 GAD1YMR250W 1758 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 RPS11AYDR025W 471 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 RAV2YDR202C 1056 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 MRP4YHL004W 1185 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 COS8YHL048W 1146 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 YVH1YIR026C 1095 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 GLG2YJL137C 1143 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 REC102YLR329W 795 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 HTA2YBL003C 399 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 DLT1YMR126C 1029 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 USV1YPL230W 1176 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS3Q08438 NAM2YLR382C 2685 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 VPS38YLR360W 1320 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 SST2YLR452C 2097 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 GSM1YJL103C 1857 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 MAG2YLR427W 2013 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 SSB1YDL229W 1842 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 BCP1YDR361C 852 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 YGL242CYGL242C 546 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 IKI1YHR187W 930 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 PFK27YOL136C 1194 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 YOR263CYOR263C 408 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 PPT2YPL148C 522 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 NCE102YPR149W 522 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 PEP5YMR231W 3090 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 URK1YNR012W 1506 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 CTR86YCR054C 1692 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 AGA1YNR044W 2178 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 REF2YDR195W 1602 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 GIP4YAL031C 2283 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 SIP1YDR422C 2448 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 NBP2YDR162C 711 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS3Q08438 YDR535CYDR535C 501 nt4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.9 ms