Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXM1Q08050 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXM1Q08050 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXM1Q08050 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXM1Q08050 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXM1Q08050 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXM1Q08050 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXM1Q08050 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXM1Q08050 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXM1Q08050 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXM1Q08050 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXM1Q08050 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXM1Q08050 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXM1Q08050 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXM1Q08050 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms