Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG1Q06432 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms