Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CD164Q04900 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD164Q04900 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD164Q04900 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD164Q04900 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD164Q04900 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms