Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms