Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms