Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB3Q01970 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLCB3Q01970 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLCB3Q01970 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLCB3Q01970 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLCB3Q01970 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms