Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC10Q01780 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms