Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFITM3Q01628 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms