Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1BQ00975 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms