Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDPQ00604 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDPQ00604 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDPQ00604 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDPQ00604 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDPQ00604 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDPQ00604 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDPQ00604 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDPQ00604 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDPQ00604 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDPQ00604 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDPQ00604 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDPQ00604 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDPQ00604 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NDPQ00604 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDPQ00604 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDPQ00604 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDPQ00604 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDPQ00604 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms