Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED6P86452 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED6P86452 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms