Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms