Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX3P78415 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX3P78415 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX3P78415 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX3P78415 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX3P78415 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX3P78415 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX3P78415 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX3P78415 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX3P78415 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX3P78415 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX3P78415 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX3P78415 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX3P78415 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX3P78415 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX3P78415 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX3P78415 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX3P78415 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX3P78415 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX3P78415 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX3P78415 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX3P78415 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX3P78415 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX3P78415 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX3P78415 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX3P78415 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX3P78415 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX3P78415 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX3P78415 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX3P78415 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX3P78415 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX3P78415 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX3P78415 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX3P78415 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX3P78415 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX3P78415 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX3P78415 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX3P78415 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX3P78415 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX3P78415 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX3P78415 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX3P78415 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX3P78415 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX3P78415 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX3P78415 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX3P78415 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX3P78415 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX3P78415 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX3P78415 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX3P78415 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX3P78415 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX3P78415 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX3P78415 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX3P78415 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX3P78415 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX3P78415 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX3P78415 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX3P78415 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRX3P78415 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
IRX3P78415 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX3P78415 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX3P78415 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX3P78415 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX3P78415 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX3P78415 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX3P78415 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX3P78415 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX3P78415 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX3P78415 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX3P78415 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX3P78415 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX3P78415 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX3P78415 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX3P78415 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX3P78415 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX3P78415 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX3P78415 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX3P78415 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX3P78415 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX3P78415 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX3P78415 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX3P78415 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX3P78415 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX3P78415 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX3P78415 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX3P78415 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX3P78415 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX3P78415 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX3P78415 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX3P78415 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX3P78415 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX3P78415 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX3P78415 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX3P78415 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX3P78415 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX3P78415 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX3P78415 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX3P78415 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX3P78415 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX3P78415 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms