Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms