Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTBP60709 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTBP60709 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTBP60709 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTBP60709 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTBP60709 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTBP60709 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTBP60709 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTBP60709 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTBP60709 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTBP60709 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTBP60709 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTBP60709 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTBP60709 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTBP60709 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTBP60709 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTBP60709 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTBP60709 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTBP60709 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTBP60709 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTBP60709 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTBP60709 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTBP60709 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTBP60709 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTBP60709 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTBP60709 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTBP60709 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTBP60709 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTBP60709 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTBP60709 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTBP60709 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTBP60709 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTBP60709 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTBP60709 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTBP60709 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTBP60709 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTBP60709 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTBP60709 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTBP60709 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTBP60709 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTBP60709 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTBP60709 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTBP60709 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTBP60709 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTBP60709 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTBP60709 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTBP60709 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTBP60709 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms