Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA1P59665 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEFA1P59665 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms