Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ4P56696 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms