Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME5P56597 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME5P56597 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME5P56597 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME5P56597 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME5P56597 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME5P56597 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME5P56597 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME5P56597 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME5P56597 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME5P56597 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME5P56597 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME5P56597 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME5P56597 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME5P56597 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME5P56597 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME5P56597 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME5P56597 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME5P56597 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NME5P56597 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME5P56597 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME5P56597 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME5P56597 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NME5P56597 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NME5P56597 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME5P56597 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME5P56597 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NME5P56597 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME5P56597 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME5P56597 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME5P56597 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME5P56597 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME5P56597 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME5P56597 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME5P56597 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME5P56597 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME5P56597 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME5P56597 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME5P56597 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME5P56597 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME5P56597 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME5P56597 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME5P56597 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME5P56597 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME5P56597 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME5P56597 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME5P56597 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME5P56597 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms