Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN5P54829 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN5P54829 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms