Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA2P54646 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA2P54646 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA2P54646 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA2P54646 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA2P54646 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA2P54646 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA2P54646 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA2P54646 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA2P54646 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA2P54646 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA2P54646 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA2P54646 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA2P54646 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA2P54646 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA2P54646 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA2P54646 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA2P54646 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA2P54646 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA2P54646 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA2P54646 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA2P54646 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA2P54646 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA2P54646 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA2P54646 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKAA2P54646 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms