Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATN1P54259 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATN1P54259 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATN1P54259 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATN1P54259 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATN1P54259 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATN1P54259 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATN1P54259 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATN1P54259 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATN1P54259 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATN1P54259 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATN1P54259 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATN1P54259 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATN1P54259 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATN1P54259 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATN1P54259 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATN1P54259 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATN1P54259 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATN1P54259 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATN1P54259 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATN1P54259 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATN1P54259 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATN1P54259 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATN1P54259 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATN1P54259 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATN1P54259 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATN1P54259 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATN1P54259 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATN1P54259 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATN1P54259 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATN1P54259 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATN1P54259 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATN1P54259 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATN1P54259 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATN1P54259 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATN1P54259 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATN1P54259 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATN1P54259 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATN1P54259 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATN1P54259 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATN1P54259 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATN1P54259 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATN1P54259 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATN1P54259 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATN1P54259 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATN1P54259 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATN1P54259 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATN1P54259 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATN1P54259 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATN1P54259 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATN1P54259 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATN1P54259 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATN1P54259 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATN1P54259 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATN1P54259 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATN1P54259 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATN1P54259 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATN1P54259 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATN1P54259 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATN1P54259 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms