Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATXN3P54252 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms