Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms