Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-5P52952 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms