Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms