Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LUMP51884 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LUMP51884 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LUMP51884 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LUMP51884 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LUMP51884 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LUMP51884 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LUMP51884 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LUMP51884 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LUMP51884 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LUMP51884 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LUMP51884 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LUMP51884 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LUMP51884 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LUMP51884 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LUMP51884 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LUMP51884 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LUMP51884 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms