Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR1P51861 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDR1P51861 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR1P51861 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR1P51861 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR1P51861 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR1P51861 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR1P51861 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR1P51861 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR1P51861 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR1P51861 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR1P51861 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR1P51861 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR1P51861 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR1P51861 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR1P51861 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR1P51861 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR1P51861 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR1P51861 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR1P51861 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR1P51861 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR1P51861 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR1P51861 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR1P51861 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR1P51861 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR1P51861 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR1P51861 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR1P51861 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR1P51861 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR1P51861 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR1P51861 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR1P51861 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR1P51861 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR1P51861 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR1P51861 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR1P51861 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR1P51861 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR1P51861 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR1P51861 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR1P51861 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR1P51861 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR1P51861 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR1P51861 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR1P51861 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR1P51861 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR1P51861 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR1P51861 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR1P51861 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR1P51861 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR1P51861 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR1P51861 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR1P51861 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR1P51861 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR1P51861 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR1P51861 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms