Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX5P50542 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX5P50542 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX5P50542 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX5P50542 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX5P50542 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX5P50542 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX5P50542 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX5P50542 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX5P50542 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX5P50542 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX5P50542 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX5P50542 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PEX5P50542 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX5P50542 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX5P50542 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX5P50542 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX5P50542 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX5P50542 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX5P50542 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX5P50542 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX5P50542 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX5P50542 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX5P50542 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX5P50542 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX5P50542 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX5P50542 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX5P50542 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX5P50542 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX5P50542 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX5P50542 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX5P50542 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX5P50542 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX5P50542 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX5P50542 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX5P50542 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX5P50542 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX5P50542 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX5P50542 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX5P50542 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX5P50542 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX5P50542 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX5P50542 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX5P50542 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX5P50542 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX5P50542 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX5P50542 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX5P50542 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX5P50542 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX5P50542 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX5P50542 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX5P50542 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX5P50542 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX5P50542 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX5P50542 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX5P50542 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX5P50542 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX5P50542 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX5P50542 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX5P50542 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PEX5P50542 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PEX5P50542 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX5P50542 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX5P50542 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX5P50542 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms