Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUP153P49790 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUP153P49790 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NUP153P49790 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NUP153P49790 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NUP153P49790 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NUP153P49790 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NUP153P49790 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NUP153P49790 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NUP153P49790 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP153P49790 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP153P49790 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP153P49790 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP153P49790 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP153P49790 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP153P49790 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP153P49790 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP153P49790 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP153P49790 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP153P49790 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP153P49790 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP153P49790 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP153P49790 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP153P49790 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP153P49790 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP153P49790 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP153P49790 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP153P49790 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP153P49790 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP153P49790 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP153P49790 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP153P49790 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUP153P49790 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUP153P49790 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUP153P49790 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUP153P49790 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUP153P49790 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUP153P49790 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUP153P49790 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUP153P49790 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUP153P49790 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUP153P49790 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUP153P49790 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUP153P49790 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUP153P49790 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUP153P49790 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUP153P49790 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUP153P49790 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUP153P49790 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NUP153P49790 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NUP153P49790 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NUP153P49790 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NUP153P49790 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NUP153P49790 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NUP153P49790 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NUP153P49790 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NUP153P49790 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NUP153P49790 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NUP153P49790 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NUP153P49790 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NUP153P49790 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP153P49790 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP153P49790 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP153P49790 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP153P49790 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP153P49790 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP153P49790 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP153P49790 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP153P49790 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP153P49790 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP153P49790 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP153P49790 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP153P49790 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP153P49790 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP153P49790 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP153P49790 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP153P49790 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP153P49790 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP153P49790 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP153P49790 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP153P49790 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP153P49790 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP153P49790 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP153P49790 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP153P49790 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP153P49790 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP153P49790 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP153P49790 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP153P49790 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP153P49790 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP153P49790 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP153P49790 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP153P49790 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP153P49790 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP153P49790 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP153P49790 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP153P49790 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP153P49790 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP153P49790 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP153P49790 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms