Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSEN1P49768 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms