Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPAP49450 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPAP49450 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPAP49450 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPAP49450 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPAP49450 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPAP49450 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPAP49450 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPAP49450 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPAP49450 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPAP49450 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPAP49450 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPAP49450 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPAP49450 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPAP49450 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPAP49450 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPAP49450 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPAP49450 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPAP49450 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPAP49450 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPAP49450 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPAP49450 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPAP49450 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPAP49450 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPAP49450 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPAP49450 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPAP49450 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPAP49450 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPAP49450 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPAP49450 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPAP49450 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPAP49450 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPAP49450 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPAP49450 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPAP49450 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPAP49450 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPAP49450 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPAP49450 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms