Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCP4P48539 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCP4P48539 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCP4P48539 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCP4P48539 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCP4P48539 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCP4P48539 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCP4P48539 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCP4P48539 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCP4P48539 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCP4P48539 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCP4P48539 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCP4P48539 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCP4P48539 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCP4P48539 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCP4P48539 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCP4P48539 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCP4P48539 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCP4P48539 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms