Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRB2P47870 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms