Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD4P46934 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms