Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL21P46778 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL21P46778 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL21P46778 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL21P46778 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL21P46778 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL21P46778 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL21P46778 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL21P46778 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL21P46778 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL21P46778 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL21P46778 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
RPL21P46778 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL21P46778 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL21P46778 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL21P46778 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL21P46778 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL21P46778 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL21P46778 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL21P46778 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL21P46778 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms