Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT3P45378 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNT3P45378 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms