Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAGEA1P43355 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAGEA1P43355 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms