Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3CAP42336 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms