Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC26A3P40879 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC26A3P40879 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms