Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP8P40818 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP8P40818 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP8P40818 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP8P40818 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP8P40818 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP8P40818 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP8P40818 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP8P40818 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP8P40818 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP8P40818 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP8P40818 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP8P40818 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP8P40818 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP8P40818 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP8P40818 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP8P40818 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP8P40818 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP8P40818 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP8P40818 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP8P40818 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP8P40818 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP8P40818 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP8P40818 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP8P40818 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP8P40818 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP8P40818 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP8P40818 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP8P40818 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP8P40818 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP8P40818 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP8P40818 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP8P40818 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP8P40818 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP8P40818 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
USP8P40818 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP8P40818 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP8P40818 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP8P40818 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP8P40818 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP8P40818 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP8P40818 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP8P40818 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP8P40818 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP8P40818 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP8P40818 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP8P40818 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP8P40818 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms