Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX1P40424 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX1P40424 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX1P40424 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX1P40424 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX1P40424 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX1P40424 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX1P40424 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PBX1P40424 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PBX1P40424 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PBX1P40424 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PBX1P40424 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PBX1P40424 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX1P40424 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX1P40424 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX1P40424 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX1P40424 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX1P40424 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX1P40424 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX1P40424 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX1P40424 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX1P40424 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX1P40424 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX1P40424 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX1P40424 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX1P40424 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX1P40424 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX1P40424 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX1P40424 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX1P40424 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX1P40424 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX1P40424 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX1P40424 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX1P40424 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX1P40424 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX1P40424 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX1P40424 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX1P40424 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX1P40424 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX1P40424 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX1P40424 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX1P40424 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX1P40424 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX1P40424 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX1P40424 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX1P40424 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX1P40424 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX1P40424 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX1P40424 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX1P40424 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX1P40424 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX1P40424 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX1P40424 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX1P40424 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX1P40424 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX1P40424 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX1P40424 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX1P40424 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX1P40424 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX1P40424 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX1P40424 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX1P40424 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX1P40424 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX1P40424 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX1P40424 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX1P40424 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX1P40424 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX1P40424 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX1P40424 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX1P40424 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX1P40424 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PBX1P40424 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX1P40424 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX1P40424 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX1P40424 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX1P40424 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX1P40424 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX1P40424 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX1P40424 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX1P40424 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX1P40424 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX1P40424 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms