Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGP37231 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGP37231 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGP37231 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGP37231 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGP37231 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGP37231 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGP37231 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGP37231 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGP37231 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGP37231 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPARGP37231 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPARGP37231 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPARGP37231 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPARGP37231 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPARGP37231 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPARGP37231 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPARGP37231 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPARGP37231 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPARGP37231 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPARGP37231 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPARGP37231 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPARGP37231 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPARGP37231 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms